Master Informatik: Angewandte Bioinformatik

Inhalte

• Python mit Fokus auf Anwendungen in bioinformatischer "Data Science"
• Workflowmanagement: Snakemake
• Analyse von High-Troughput-Sequencing Daten
• Genome Assembly
• Analyse biologischer Netzwerke
• Bestimmung evolutionär verwandter Gene (Orthologe)
• Berechnung von Stammbäumen
• Identifizierung von Genen, die Zeichen natürlicher Auslese zeigen (dN/dS)
• Modellierung der Evolution von DANN-Sequenzen

Modulbeschreibung

Verwendbarkeit des Moduls:

• Master-Studiengang Informatik (als Wahlpflicht- oder Schwerpunkt-Modul)
• Individuelle Ergänzung im Master-Studiengang Informatik
• Anwendungsfach im Bachelor-Studiengang Mathematik und Anwendungsgebiete

Vorlesung

Die Vorlesung findet montags von 10:30 Uhr bis 12:00 Uhr in Raum 25.02.O2.21 statt. Die Vorlesung beginnt am 01.04.2019.

Übungen

Die Übung findet donnerstags von 14:30 Uhr bis 16:00 Uhr in Raum 25.02.O2.21 statt.

Seminar

Termin nach Vereinbarung.

Kreditpunkte

5 CP

Teilnahmevoraussetzungen

Informatik

Erfolgreiche Teilnahme an "Programierung", "Rechnerarchitektur", "Algorithmen und Datenstrukturen" und "Theoretische Informatik (Informatik I - IV)

Anmeldungen zum Kurs erfolgen über das elektronische Vorlesungsverzeichnis.

Literatur

Wird im Rahmen der Vorlesung vorgestellt

Fragen?

Jederzeit an  Martin Lercher.