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Mathematische Modellierung und statistische Analyse biologischer Systeme

Mathematische Modellierung und statistische Analyse biologischer Daten

Modulinformation

Dieses Vollmodul wird veranstaltet vom Lehrstuhl "Mathematische Modellierung biologischer Systeme" der Biologie. Weitere Hinweise erhalten Sie undefinedhier.

Inhalte

Einführung in die Wahrscheinlichkeitsrechung:

  • Statistische Verteilungen (z.B. Binomialverteilung, Normalverteilung)
  • Hypothesen testen
  • Parametrische Tests (z.B. Student t-test)
  • Permutationstest
  • Bootstrap Methode

Modulbeschreibung

Teil 1: Statistische Datenanalyse. Dieser Vorlesungsteil behandelt die Grundlagen der deskriptiven Statistik und die wichtigsten statistische Testverfahren. Die Studenten erlernen den Umgang mit Begriffen wie ‚Nullhypthese’ und ‚Alternative Hypothese’ und quantitative Beurteilungsmethoden von Testproblemen. Die charakteristischen Werte zur Beurteilung statistischer Signifikanz, z.B. p-Wert und Chi-Quadrat-Wert, werden anschaulich eingeführt. In diesem Zusammenhang werden die möglichen Fehlerquellen in der Berechnung der statistischen Signifikanz behandelt.

Teil 2: Netzwerk Rekonstruktion. Dieser Vorlesungsteil behandelt Methoden, die es ermöglichen regulatorische zelluläre Netwerke aus Hochduchsatzdaten zu rekonstruieren. Eine zentrale Anwendung ist dabei die Rekonstruktion von genregulatorischen Netzwerken aus Transkriptionsdaten. Die verschiedenen Methoden werden am Computer mit realen Datensätzen getestet.

Teil 3: Biochemische Schalter und Oszillatoren. Dieser Vorlesungsteil behandelt die mathematischen Grundlagen dynamischer Systeme. Wesentlicher Fokus liegt dabei auf bistabilen biochemischen Systemen, welche eine zentrale Rolle in der Entwicklungsbiologie spielen und oszillatorische Systeme, welche die Ursache für zirkadiane Rhythmen sind.

Verwendbarkeit des Moduls:

  • Master-Studiengang Informatik (als Schwerpunkt-Modul "Bioinformatik")
  • Masterstudiengang Biologie

Vorlesung/Übung

Wann und ob die Veranstaltung statt findet entnehmen Sie dem HIS-LSF.

Seminar

Studierende im Masterstudiengang Informatik müssen zusätzlich einen Seminarvortrag halten. Es werden verschiedene Themen zur Auswahl bereitgestellt und der Termin wird zu Beginn des Semesters in Absprache vereinbart.

Kreditpunkte:

15 CP

Teilnahmevorraussetzungen/Anmeldung

Informatiker

Erfolgreiche Teilnahme an Informatik 1 bis 4.

Anmeldungen zum Kurs erfolgen über das elektronische Vorlesungsverzeichnis.

Klausur

Die Klausur findet nach Vereinbarung statt.

Nachklausur

Die Nachklausur findet nach Vereinbarung statt.

Fragen?

Jederzeit an .

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