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Abgeschlossene Arbeiten

2021

  • "Konstruktion eines Planungsmodells für Aussaatzeiten unter Unsicherheit des tatsächlichen Erntezeitpunkts", Bachelorarbeit, Jan van Grimbergen
  • "Solving Connected Dominating Set Variants Using Constraint Programming", Bachelorarbeit, Tim Pfalz
  • "Snakemake as a workflow engine for reciprocal BLAST analyses", Bachelorarbeit, Lukas Becker
  • "Logic models to classify cancer types based on tumor DNA samples", Masterarbeit, Nguyen Khoa Tran

2020

  • "Aggregieren von gerichteten azyklischen Graphen unter Verwendung von ganzzahliger linearer Programmierung", Bachelorarbeit, Max Oerter
  • "Using anticlustering to maximize diversity and dispersion: Comparing exact and heuristic approaches", Bachelorarbeit, Martin Breuer
  • "Solving Connected Dominating Set Variants Using Integer Linear Programming", Bachelorarbeit, Mario Surlemont
  • "Klassifizierung von Krebsarten durch Tumor-DNA mittels Support-Vektor-Maschinen und künstlichen neuronalen Netzen" Bachelorarbeit, Roman Jumatov
  • "Developing a Cytoscape app to solve k-cluster-editing using fast heuristics", Bachelorarbeit, Lukas Ettel
  • "k-mer Based Typing of Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus", Masterarbeit, Philipp Spohr
  • "Developing a Snakemake Workflow for Gene Set Enrichment Analysis", Bachelorarbeit, Lars Meinke
  • "A user-friendly Snakemake pipeline for differential expression analysis", Bachelorarbeit, Julian Kremer
  • "Solving the maximum allele co-occurrence problem for single individual haplotype phasing with Integer Linear Programming", Bachelorarbeit, Sarah Schweier
  • "Automated Immunophenotyping of Multi-Experimental Flow Cytometry Data", Masterarbeit, Manuel Lentzen
  • "Computing a Maximum Common Edge Subgraph of Two Molecular Graphs", Bachelorarbeit, Adrian Prinz
  • "Das-Homo-Edit-Distanz-Problem", Bachelorarbeit, Maren Brand
  • "Detection of somatic mutations and loss-of-heterozygosity events in a cohort of Glioblastoma patients", Bachelorarbeit, Sara Chantal Schulte
  • "Applying trio phasing to identify germline de novo mutations in children with cancer", Bachelorarbeit, Frederik Oehl
  • "Solving Dominating Set Using Answer Set Programming" Bachelorarbeit, My Ky Huynh
  • "Evaluating different methods for aircraft boarding" Bachelorarbeit, Hao Tian
  • "On a String Partitioning Problem" Bachelorarbeit, Michael Wulfert
  • "Contig-Assembly der MHC-Region mittels kräftebasierter Verfahren", Bachelorarbeit, Jan Höckesfeld

2019

  • "Contig-Assembly der MHC-Region mittels Linearer Programmierung", Bachelorarbeit, Marvin Lindemann
  • "Learning partial charges", Masterarbeit, Jakob Schlegel
  • "Vorhersage von Methicillin-resistenten Staphylococcus-aureus-Typen mittels Deep Learning", Bachelorarbeit, Andre Walter
  • "Assignment of partial charges to identical atom neighborhoods of drug-like molecules", Bachelorarbeit, Richard Michael Geller
  • "Solving the Maximum Weight Connected Subgraph Problem using Color Coding", Masterarbeit (VU Amsterdam), Eline van Mantgem
  • "Lagrangian Relaxation for the Generalized Robinson-Foulds Metric", Bachelorarbeit, Laura Christine Kühle
  • "Network analysis of heart infarction mice transcriptomes", Bachelorarbeit, Caroline Jachmann

2018

  • "Bestimmung des HLA-Genotyps auf Basis von genomweiter Sequenzierung und k-mer-Häufigkeiten", Bachelorarbeit, Yulian Martynovsky
  • "Creating similar item sets using integer linear programming with an application to questionnaire design in experimental psychology", Bachelorarbeit, Martin Papenberg
  • "Cluster Editing mit ganzzahliger linearer Programmierung: eine Open-Source-Lösung",
    Bachelorarbeit, Martin Klümpen
  • "Identifying significant targets of molecular fragments", Bachelorarbeit, Jonas Weber,
  • "Enrichment-Analyse viral deregulierter Signalmodule in Glioblastom-Zelllinien", Bachelorarbeit, Jonas König
  • "Das Maximum-Weight Connected Subgraph Problem auf Bäumen", Bachelorarbeit, Jan Seipp
  • "Visualisation of atom groups in molecuar graphs", Bachelorarbeit, Gareth Bilaney
  • "Pipeline zur Identifizierung funktionaler Module auf Basis von Onkoproteomikdaten", Bachelorarbeit, Anne Abraham
  • "Identifying functional modules in Arabidopsis thaliana root development", Bachelorarbeit, Felix Grünewald

2017

  • "Developing and evaluating a Cytoscape app for graph-based clustering", Bachelorarbeit, Philipp Spohr
Verantwortlichkeit: